人类最后的城市锡安面临百万机械乌贼的碾压。尼奥在与“火车人”的战斗中失去了视觉，却获得了感知代码流的能力。为了阻止史密斯病毒的扩散（甚至威胁到机械城市），尼奥与机械大帝达成协议：他进入矩阵消除史密斯，机械撤军。在矩阵倾覆的暴雨中，尼奥与已经神化的史密斯进行了一场超越物理法则的决战。尼奥选择拥抱毁灭，与史密斯同归于尽，代码归零，系统重启。
影片短评
视觉特效再次引领时代，特别是机械乌贼围攻锡安的长镜头令人窒息。虽然哲学探讨让位于视觉轰炸，但尼奥作为“人”而非“救世主”的选择依然动人。结局的悲壮与希望并存，完美收官。
